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在计算机中，系统文件指的是一些最为关键的计算机文件，计算机离开它们便无法正常运行。这些文件可能是操作系统的一部分，第三方的设备驱动或其他的资源。Microsoft Windows和MS-DOS将系统文件用“系统”属性进行标记，以防止被意外删除（虽然带有“系统”属性的文件可以手动改为任意类型的文件，但一般的文件无法改为系统文件）。系统文件是两个主要文件之一，包括经典的Mac操作系统从原来的版本到OS 9.2.2，另一个是Macintosh查找器。系统文件与查找器文件一起位于系统文件夹中，其中包含键盘布局、FKEY 资源、声音以及系统 6、位图字体和桌面附件。
系统文件的例子包括在MS-DOS和Windows中的带有.sys文件扩展名的文件、Mac OS系统中位于sys的文件和“System suitcase”，以及Linux文件系统、sysfs中的根文件夹中的文件。